بدأت طيران الإمارات عملياتها في القارة الأفريقية في العام 1986 عندما دشنت الناقلة خدماتها إلى القاهرة، التي كانت أولى وجهاتها الأفريقية بعد مرور أقل من عام على تأسيسها. وتسير الناقلة حالياً 209 رحلات أسبوعياً إلى 22 وجهة في أفريقيا، هي: أبيدجان، أكرا، أديس أبابا، القاهرة، كيب تاون، الدار البيضاء، دكار، دار السلام، ديربان، عنتيبي ، جوهانسبرغ، الخرطوم، لاغوس، لواندا، نيروبي، طرابلس، تونس، هراري، لوساكا، كوناكري، الجزائر،أبوجا، موريشيوس وسيشيل. كما تشغل الإمارات للشحن الجوي رحلات شحن إلى خمس وجهات هي: إلدوريت وليلونجوي وجيبوتي وكانو وبوركينافاسو. وتلعب طيران الإمارات دوراً فعالاً في تسهيل تدفق حركة المسافرين والشحنات بين أفريقيا ومختلف أنحاء العالم من خلال رحلات الركاب والشحن، ما يتيح ربط الدول الأفريقية مع مختلف شركائها التجاريين عبر العالم.