شكلت وزارة التربية والتعليم لجنتين لجائزة التربية والتعليم للتميز، إحداهما لجنة عليا للجائزة برئاسة نائب الوزير لشؤون البنين وعضوية كل من وكيل الوزارة لتعليم البنين نائبا للرئيس، وكيل الوزارة لتعليم بنات، وكيل الوزارة للشؤون المدرسية، أمين عام إدارات التربية والتعليم، كيل الوزارة المشرف العام على الشؤون المالية والإدارية، الرئيس التنفيذي لشركة تطوير الخدمات التعليمية أمين عام الجائزة عضوا ومقررا، وتعقد اللجنة اجتماعها دوريا بما لا يقل عن مرتين في الدورة الواحدة وتستعين بمن تراه من أهل الاختصاص. أما اللجنة الإشرافية على الجائزة فهي برئاسة وكيل الوزارة لتعليم البنين وعضوية أمين عام الجائزة، ممثل من شركة تطوير الخدمات التعليمية وكالة تعليم بنين وبنات، ممثل من الأمانة العامة، ممثل من الإدارة العامة للشؤون المالية والإدارية، ممثل عن مؤسسة الملك عبدالعزيز ورجاله للموهبة والإبداع، مدير عام شؤون المعلمين، مدير الإعلام التربوي والمدير التنفيذي للجائزة عضوا ومقررا.