أوضحت مصادر قانونية أن الرئيس السابق مرسي وعددا كبيرا من أعضاء جماعة الإخوان المسلمين سوف تلاحقهم العديد من الاتهامات التي ستتسبب حال ثبوتها ضدهم بإحالتهم إلى المحاكمات الجنائية عن وقائع تتراوح العقوبة فيها حال الإدانة، ما بين السجن المشدد وحتى الإعدام شنقا. وأشارت المصادر إلى أن مرسي وعددا من قيادات جماعة الإخوان المسلمين، سيمثلون أمام النيابة العامة الاثنين المقبل بتهم قد تصل إلى «الخيانة العظمى» لقيامهم بالاستعانة بعناصر دولة خارجية في تهريبهم من سجن وادي النطرون في أحداث ثورة 25 يناير، وهو الأمر الذي سبق أن كشف النقاب عنه عمر سليمان رئيس جهاز المخابرات السابق في شهادته في قضية محاكمة الرئيس الأسبق مبارك، والتي ورد فيها أن عناصر من حركة حماس وحزب الله اللبناني، قامت بالدخول إلى البلاد خلسة وعبر الأنفاق السرية. كما تجري نيابة جنوب القاهرة الكلية تحقيقا مع الدكتور محمد بديع المرشد العام لجماعة الإخوان والمهندس خيرت الشاطر نائب المرشد وآخرين في شأن اتهامهم بالتحريض على قتل 8 متظاهرين سلميين أمام مقر مكتب إرشاد الجماعة بضاحية المقطم، وهي القضية التي إذا ثبت إدانتهم فيها فستواجههم عقوبة الإعدام. من جهة أخرى، يبدأ مستشار التحقيق المنتدب من وزير العدل للتحقيق في وقائع إهانة السلطة القضائية والإساءة إلى رجالها تحقيقات موسعة مع مرسي في ضوء خطاب له مؤخرا تهكم فيه على السلطة القضائية ورجالها واتهم أحد مستشاريها بتزوير الانتخابات التشريعية عام 2005 وهي القضية التي سيحقق معه فيها أيضا 8 آخرين من كوادر وقيادات الإسلام السياسي لسبهم القضاة. وأصدر المستشار ثروت حماد مستشار التحقيق المنتدب من وزير العدل المصري للتحقيق في وقائع الإساءة للسلطة القضائية ورجالها، قرارا بإدراج اسم الدكتور محمد مرسي رئيس الجمهورية السابق، و8 متهمين آخرين معظمهم من قيادات جماعة الإخوان المسلمين، ضمن قوائم المنع من مغادرة البلاد وترقب الوصول، على أن يبدأ التحقيق معهم اعتبارا من «الاثنين» القادم في قضية اتهامهم بسب وإهانة السلطة القضائية ورجالها. والمتهمون في هذه القضية هم كل من: الرئيس السابق محمد مرسي ومحمد الكتاتني رئيس مجلس الشعب السابق ومحمد البلتاجي عضو مجلس الشعب السابق ومحمد مهدي عاكف المرشد العام لجماعة الإخوان السابق وصبحي صالح عضو مجلس الشورى ومحمد جمال جبريل عضو مجلس الشورى وطاهر عبد المحسن أحمد سليمان وكيل اللجنة التشريعية بمجلس الشورى وعصام سلطان عضو مجلس الشعب السابق ومحمد محمد علي حامد وشهرته محمد العمدة عضو مجلس الشعب السابق