أصدر سمو الشيخ حمدان بن محمد بن راشد آل مكتوم ولي عهد دبي رئيس المجلس التنفيذي قرار المجلس رقم 54 لسنة 2016 باعتماد الهيكل التنظيمي لهيئة المعرفة والتنمية البشرية في دبي. ووفقا للقرار يكون لرئيس مجلس المديرين ومدير عام الهيئة إصدار القرارات اللازمة لتنفيذ أحكام هذا القرار بما في ذلك اعتماد مهام الوحدات التنظيمية المشمولة بالهيكل التنظيمي المُعتمد بموجب أحكامه ويلغى أي نص في أي قرار آخر إلى المدى الذي يتعارض فيه وأحكام هذا القرار ويعمل به من تاريخ صدوره وينشر في الجريدة الرسمية.