تقع كنيسة القديسة بربارة في الجانب الشرقي لحصن بابليون وقريبة من الجدار الروماني ويصل اليها الزائر من شارع المعبد اليهودي.- تُحاط الكنيسة بكثير من المباني البسيطة الخاصة بالسكان، وكذلك المنشآت الكنسية التي تغيرت معالمها الآن، وقد عانت الكنيسة كثيرا من الترميمات الضارة بأصوله الأولى.- تأسست كنيسة القديسة بربارة في القرن الخامس الميلادى، وكُرِّسَتْ على اسم القديسة برباره التى كانت فتاة عذراء رائعة الجمال كما يُقال أنها ولدت في أوائل القرن الثالث الميلادي.- تعرضت هذه الكنيسة، وكنيسة أبي سرجة للهدم والتخريب في القرن العاشر، وقيل أنه قد أعاد بنائها أحد وزراء القبط وهو "يوحنا بن الأبح" في عصر الدولة الفاطمية.- تصميم كنيسة القديسة برباره على الطراز الأرثوذوكسى الأصلى ولها صحن وجناحان يفصلهما عن الصحن عشرة أعمدة خمسة من كل جانب، ثم اثنان في الناحية الغربية أمام المدخل، وفوق هذه الاعمدة الرخامية التيجان كما في الكنائس الاخري.- تتكون نقوش التيجان لى شكل سعف النخيل، وكانت تزين سطوحها الرسوم الملونة بأشكال الرسل والأنبياء رمزا للتعاليم التى تقوم عليها كنيسة المسيح، وهذه الأعمدة متصلة بافريز خشبي مستمر.- - يوجد في صحن الكنيسة "اللقان" المعد لغسل الأرجل كالمعتاد، ويقع شمال صحن الكنيسة المنبر"الانبل" الرخامى وهو على نمط منبر كنيسة أبى سرجة المجدد في الشرائح الرخامية الملونة، وعلى لوحته الرئيسية نقوش بارزة تمثل صلبانا داخل أكاليل زخرفية وعليها آثار الألوان ويقوم على عشرة أعمدة رخامية صغيرة. - أمام الصحن يقع الحجاب الرئيسى الأوسط "حامل الأيقونات" للكنيسة وهو من خشب الجوز وتتخلله حشوات من العاج والأبنوس المنقوش بزخارف نباتية أشبه بنقوش أحجبة كنيستي المعلقة وأبي سرجة ولكنها أحدث منها عهدا. - يوجد فوق الحجاب بعض الحشوات الخشبية ذوات النقوش الدقيقة المفرغة التي ترجع غالبًا إلى ما بين القرن الحادي عشر والثالث عشر، ثم توجد حشوات أخرى مستطيلة من العاج الخالص المزخرف. - تعلو الحشوات المذكورة الأيقونات المثبتة فوق الحجاب وهو عبارة عن تسع صور كبيرة الحجم داخل إطارات خشبية، ترجع إلى القرن الثامن عشر. - فوق منتصف افريز الأيقونات توجد صورة كبيرة بالألوان الزاهية تمثل العشاء الربانى ويبرز من وسطها إلى أعلى صليب كبير عليه صورة للسيد المسيح وهو مصلوب وعلى أركانه الثلاثة الأعلى والأيمن والأيسر صور صغيرة بالألوان لملائكة - والصورة الأخيرة والصليب من رسوم حديثة العهد. - يلى الحجاب الأوسط للهيكل الرئيسي للكنيسة الذى كُرِّسَ على اسم القديسة برباره ويوجد في وسطه مذبح رخامى وهو حديث الصنع، وفوقه القبة الخشبية وهي ترتكز على أربعة أعمدة رخامية. - أمام الهيكل عقد كبير مرتفع وأهميته ترجع إلى الأخشاب القديمة التى تغطى الجزء العلوى منه، وهى تحمل آثار الرسوم الملونة القديمة التي كانت تزين الكنيسة بعد عمارتها الثانية.